科研处是负责学校科学研究管理工作的职能部门，主要负责科研政策制定、规划布局、平台建设、项目组织、成果管理、科研奖励、学术治理体系建设，还负责学校社科联、美育研究中心、学报编辑部、北疆艺术研究中心的日常事务性工作，下设科研计划与项目管理科、科研成果与转化管理科、北疆艺术研究院3个科室，1个不定行政级别的机构学报编辑部。主要对接上级部门为教育厅科技与合作交流处、自治区党委宣传部理论处、内蒙古社科联。